Zijn spel werd geroemd om zijn virtuositeit en theatrale flair. Als uitvoerend musicus werd hij vaak hoger aangeslagen dan zijn eminente tijdgenoten, waaronder César Franck. Lefébure-Wély stond bekend om zijn indrukwekkende techniek en expressieve interpretaties, wat hem tot een van de meest gerespecteerde organisten van zijn tijd maakte.
Hoewel zijn composities minder diepgaand en complex zijn dan die van sommige van zijn collega’s, hebben ze wel bijgedragen aan de popularisering van het orgel als concertinstrument. Zijn werk wordt gekenmerkt door toegankelijkheid, elegantie en een gevoel voor publiekswerking. Ondanks dat zijn oeuvre in de schaduw staat van de meer monumentale werken van componisten als Franck, blijft Lefébure-Wély’s invloed op het Franse orgelspel en de ontwikkeling van de romantische orgelstijl onmiskenbaar. Zijn muziek is nog altijd een waardevol onderdeel van het Franse orgelrepertoire.
